Cassandra Nova n'est pas un être biologique au sens ordinaire, elle est un Mummudrai, entité psychique qui, selon la mythologie Shi'ar, est l'opposé psychique d'une âme. Elle a pris forme dans le ventre de la mère de Charles Xavier, se développant comme un parasite jumeau. L'enfant Xavier, sentant sa présence hostile, a tenté de la détruire in utero via ses pouvoirs télépathiques naissants. Cassandra a survécu, sans corps propre, pendant des décennies avant de reconstituer un corps à partir de matériel biologique disponible. Elle arrive dans le monde adulte avec toute la haine d'un être qui a été tenté d'être effacé avant même de naître.

Cassandra Nova apparaît dans New X-Men #114 (2001), créée par Grant Morrison et Frank Quitely. Elle est l'antagoniste principal de l'arc d'ouverture de Morrison sur les X-Men, arc qui commence par l'un des actes les plus dévastateurs, elle prend le contrôle des Sentinelles Sécurité de l'industriel Donald Trask et les envoie détruire Génosha, tuant seize millions de mutants en quelques heures. Ses pouvoirs télépathiques et télékinétiques égalent ou dépassent ceux de Xavier, avec qui elle partage une connexion psychique qui rend les affrontements directs particulièrement complexes. Elle prend le contrôle du corps de Xavier, lui envoie des X-Men déguisée en lui, et infiltre l'Institut Shi'ar. Sa lutte contre les X-Men est l'une des plus brutales et des plus philosophiquement denses, Morrison utilise Cassandra pour poser des questions fondamentales sur la haine, l'identité et ce que signifie exister comme entité définie uniquement par son opposition à quelqu'un d'autre.

Dans New X-Men #115 (2001), Cassandra Nova prend le contrôle des Sentinelles et les utilise pour attaquer Génosha, entraînant la mort de millions de mutants en très peu de temps. Magneto survit suffisamment longtemps pour être témoin de la destruction totale de son peuple. La scène, mise en scène avec une sobriété graphique marquée par Frank Quitely, transforme l’événement en une expérience de lecture froide et traumatique, où la violence n’est jamais spectaculaire mais systématique.

Cassandra Nova est l'antagoniste le plus conceptuellement audacieux créé pour les X-Men depuis des décennies, une entité dont l'existence même est une remise en question de l'idéalisme de Charles Xavier. Son importance tient à l'ampleur du génocide de Génosha et à la profondeur philosophique que Grant Morrison lui confère. Le thème central qu'elle incarne est celui de la haine comme identité, exister uniquement en opposition à quelqu'un d'autre, sans rien à soi.